Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms