Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnb1P62874 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnb1P62874 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms