Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vsnl1P62761 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms