Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf6P62331 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf6P62331 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf6P62331 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf6P62331 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arf6P62331 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arf6P62331 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf6P62331 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf6P62331 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf6P62331 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf6P62331 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms