Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms