Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms