Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps29P62274 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps29P62274 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps29P62274 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps29P62274 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps29P62274 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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