Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme3P61290 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme3P61290 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme3P61290 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme3P61290 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme3P61290 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms