Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms