Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppfia3P60469 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms