Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CgnP59242 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CgnP59242 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CgnP59242 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CgnP59242 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CgnP59242 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CgnP59242 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CgnP59242 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CgnP59242 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CgnP59242 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CgnP59242 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CgnP59242 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CgnP59242 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CgnP59242 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CgnP59242 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CgnP59242 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CgnP59242 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CgnP59242 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CgnP59242 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CgnP59242 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CgnP59242 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CgnP59242 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CgnP59242 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CgnP59242 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CgnP59242 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CgnP59242 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CgnP59242 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CgnP59242 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CgnP59242 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CgnP59242 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CgnP59242 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CgnP59242 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CgnP59242 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CgnP59242 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CgnP59242 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CgnP59242 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CgnP59242 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CgnP59242 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CgnP59242 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CgnP59242 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CgnP59242 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CgnP59242 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CgnP59242 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CgnP59242 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CgnP59242 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CgnP59242 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CgnP59242 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CgnP59242 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CgnP59242 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CgnP59242 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CgnP59242 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CgnP59242 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CgnP59242 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CgnP59242 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CgnP59242 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CgnP59242 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CgnP59242 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CgnP59242 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CgnP59242 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CgnP59242 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CgnP59242 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CgnP59242 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CgnP59242 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CgnP59242 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CgnP59242 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CgnP59242 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CgnP59242 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CgnP59242 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CgnP59242 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CgnP59242 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CgnP59242 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CgnP59242 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CgnP59242 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CgnP59242 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CgnP59242 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CgnP59242 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CgnP59242 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CgnP59242 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CgnP59242 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CgnP59242 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CgnP59242 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CgnP59242 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CgnP59242 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CgnP59242 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CgnP59242 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CgnP59242 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CgnP59242 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CgnP59242 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CgnP59242 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CgnP59242 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CgnP59242 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CgnP59242 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CgnP59242 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CgnP59242 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CgnP59242 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CgnP59242 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CgnP59242 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CgnP59242 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CgnP59242 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CgnP59242 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms