Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms