Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdsp1P58466 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms