Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strn4P58404 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strn4P58404 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn4P58404 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn4P58404 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn4P58404 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Strn4P58404 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Strn4P58404 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Strn4P58404 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Strn4P58404 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Strn4P58404 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Strn4P58404 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Strn4P58404 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms