Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opa1P58281 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Opa1P58281 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opa1P58281 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opa1P58281 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opa1P58281 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opa1P58281 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Opa1P58281 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opa1P58281 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opa1P58281 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opa1P58281 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opa1P58281 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opa1P58281 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opa1P58281 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opa1P58281 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opa1P58281 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opa1P58281 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Opa1P58281 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opa1P58281 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opa1P58281 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Opa1P58281 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opa1P58281 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opa1P58281 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opa1P58281 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opa1P58281 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Opa1P58281 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Opa1P58281 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Opa1P58281 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opa1P58281 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opa1P58281 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opa1P58281 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Opa1P58281 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Opa1P58281 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Opa1P58281 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Opa1P58281 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Opa1P58281 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Opa1P58281 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Opa1P58281 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Opa1P58281 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opa1P58281 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opa1P58281 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opa1P58281 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Opa1P58281 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opa1P58281 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Opa1P58281 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opa1P58281 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opa1P58281 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms