Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dpf3P58269 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms