Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snrpa1P57784 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms