Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd5P56812 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcd5P56812 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms