Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GemP55041 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GemP55041 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GemP55041 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GemP55041 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GemP55041 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GemP55041 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GemP55041 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GemP55041 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GemP55041 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GemP55041 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GemP55041 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GemP55041 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GemP55041 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GemP55041 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GemP55041 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GemP55041 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GemP55041 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GemP55041 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GemP55041 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GemP55041 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GemP55041 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GemP55041 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GemP55041 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GemP55041 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GemP55041 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GemP55041 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GemP55041 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GemP55041 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GemP55041 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GemP55041 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GemP55041 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GemP55041 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GemP55041 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GemP55041 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GemP55041 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GemP55041 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GemP55041 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GemP55041 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GemP55041 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GemP55041 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GemP55041 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GemP55041 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GemP55041 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GemP55041 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GemP55041 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GemP55041 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GemP55041 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GemP55041 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GemP55041 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GemP55041 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GemP55041 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GemP55041 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GemP55041 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GemP55041 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GemP55041 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GemP55041 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GemP55041 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GemP55041 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GemP55041 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GemP55041 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GemP55041 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GemP55041 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GemP55041 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GemP55041 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GemP55041 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GemP55041 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GemP55041 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GemP55041 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GemP55041 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GemP55041 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GemP55041 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GemP55041 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GemP55041 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GemP55041 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GemP55041 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GemP55041 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GemP55041 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GemP55041 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GemP55041 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GemP55041 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GemP55041 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GemP55041 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GemP55041 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GemP55041 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GemP55041 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GemP55041 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms