Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccr5P51682 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccr5P51682 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccr5P51682 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccr5P51682 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccr5P51682 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccr5P51682 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr5P51682 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms