Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms