Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TspoP50637 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TspoP50637 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TspoP50637 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TspoP50637 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TspoP50637 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TspoP50637 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TspoP50637 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TspoP50637 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TspoP50637 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TspoP50637 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TspoP50637 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TspoP50637 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TspoP50637 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TspoP50637 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TspoP50637 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TspoP50637 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TspoP50637 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TspoP50637 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TspoP50637 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TspoP50637 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TspoP50637 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TspoP50637 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TspoP50637 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TspoP50637 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TspoP50637 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TspoP50637 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TspoP50637 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TspoP50637 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TspoP50637 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TspoP50637 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TspoP50637 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TspoP50637 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TspoP50637 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TspoP50637 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TspoP50637 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TspoP50637 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TspoP50637 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TspoP50637 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TspoP50637 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TspoP50637 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TspoP50637 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TspoP50637 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TspoP50637 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TspoP50637 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TspoP50637 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TspoP50637 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TspoP50637 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TspoP50637 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TspoP50637 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TspoP50637 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TspoP50637 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TspoP50637 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TspoP50637 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TspoP50637 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TspoP50637 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TspoP50637 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TspoP50637 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TspoP50637 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TspoP50637 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TspoP50637 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TspoP50637 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TspoP50637 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TspoP50637 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TspoP50637 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TspoP50637 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TspoP50637 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TspoP50637 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TspoP50637 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TspoP50637 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TspoP50637 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TspoP50637 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms