Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdi1P50396 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms