Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxc13P50207 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms