Protein–RNA interactions for Protein: P49764

Pgf, Placenta growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgfP49764 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PgfP49764 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PgfP49764 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PgfP49764 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PgfP49764 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PgfP49764 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PgfP49764 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PgfP49764 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PgfP49764 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PgfP49764 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PgfP49764 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PgfP49764 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PgfP49764 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PgfP49764 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PgfP49764 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PgfP49764 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PgfP49764 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PgfP49764 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PgfP49764 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PgfP49764 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PgfP49764 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PgfP49764 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PgfP49764 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PgfP49764 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PgfP49764 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PgfP49764 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PgfP49764 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PgfP49764 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PgfP49764 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PgfP49764 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PgfP49764 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PgfP49764 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PgfP49764 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PgfP49764 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PgfP49764 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PgfP49764 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PgfP49764 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PgfP49764 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PgfP49764 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PgfP49764 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PgfP49764 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PgfP49764 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PgfP49764 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PgfP49764 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PgfP49764 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PgfP49764 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PgfP49764 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PgfP49764 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PgfP49764 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PgfP49764 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PgfP49764 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PgfP49764 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PgfP49764 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PgfP49764 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PgfP49764 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PgfP49764 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PgfP49764 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PgfP49764 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PgfP49764 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PgfP49764 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PgfP49764 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PgfP49764 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PgfP49764 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PgfP49764 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PgfP49764 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PgfP49764 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PgfP49764 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PgfP49764 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PgfP49764 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PgfP49764 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PgfP49764 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PgfP49764 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PgfP49764 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PgfP49764 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PgfP49764 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PgfP49764 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PgfP49764 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PgfP49764 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PgfP49764 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PgfP49764 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PgfP49764 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PgfP49764 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PgfP49764 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PgfP49764 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PgfP49764 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PgfP49764 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms