Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdk5P49615 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms