Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc3P49135 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc3P49135 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms