Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnni3P48787 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms