Protein–RNA interactions for Protein: P48744

Ndp, Norrin, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdpP48744 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdpP48744 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdpP48744 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdpP48744 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdpP48744 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdpP48744 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdpP48744 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdpP48744 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdpP48744 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdpP48744 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdpP48744 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdpP48744 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdpP48744 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdpP48744 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdpP48744 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdpP48744 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdpP48744 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdpP48744 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NdpP48744 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdpP48744 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdpP48744 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdpP48744 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdpP48744 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdpP48744 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdpP48744 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdpP48744 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdpP48744 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdpP48744 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdpP48744 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdpP48744 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdpP48744 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdpP48744 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdpP48744 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdpP48744 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdpP48744 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdpP48744 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdpP48744 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdpP48744 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdpP48744 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NdpP48744 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NdpP48744 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdpP48744 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdpP48744 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdpP48744 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdpP48744 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdpP48744 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdpP48744 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdpP48744 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NdpP48744 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdpP48744 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdpP48744 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdpP48744 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NdpP48744 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NdpP48744 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdpP48744 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NdpP48744 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms