Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prox1P48437 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prox1P48437 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prox1P48437 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms