Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx1P48377 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms