Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms