Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scg3P47867 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg3P47867 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg3P47867 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg3P47867 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg3P47867 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg3P47867 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg3P47867 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg3P47867 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg3P47867 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg3P47867 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg3P47867 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scg3P47867 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms