Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brcc3P46737 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Brcc3P46737 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms