Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11bP46638 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms