Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms