Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr3P43300 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr3P43300 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr3P43300 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr3P43300 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr3P43300 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr3P43300 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr3P43300 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr3P43300 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr3P43300 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr3P43300 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Egr3P43300 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Egr3P43300 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms