Protein–RNA interactions for Protein: P43276

Hist1h1b, Histone H1.5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h1bP43276 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hist1h1bP43276 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h1bP43276 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms