Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nr2f2P43135 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms