Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-2P42586 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-2P42586 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-2P42586 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-2P42586 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-2P42586 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-2P42586 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms