Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ighmbp2P40694 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighmbp2P40694 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ighmbp2P40694 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ighmbp2P40694 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighmbp2P40694 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms