Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox7P40646 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox7P40646 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox7P40646 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox7P40646 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox7P40646 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox7P40646 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox7P40646 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox7P40646 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox7P40646 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox7P40646 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox7P40646 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox7P40646 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox7P40646 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox7P40646 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox7P40646 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox7P40646 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox7P40646 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox7P40646 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox7P40646 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox7P40646 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox7P40646 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox7P40646 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox7P40646 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox7P40646 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox7P40646 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox7P40646 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox7P40646 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox7P40646 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox7P40646 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox7P40646 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms