Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VhlP40338 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VhlP40338 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VhlP40338 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VhlP40338 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VhlP40338 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VhlP40338 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VhlP40338 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VhlP40338 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VhlP40338 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VhlP40338 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VhlP40338 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VhlP40338 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VhlP40338 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VhlP40338 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VhlP40338 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VhlP40338 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VhlP40338 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VhlP40338 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VhlP40338 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VhlP40338 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VhlP40338 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VhlP40338 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VhlP40338 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VhlP40338 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VhlP40338 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VhlP40338 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VhlP40338 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VhlP40338 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VhlP40338 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VhlP40338 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VhlP40338 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VhlP40338 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VhlP40338 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VhlP40338 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VhlP40338 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VhlP40338 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VhlP40338 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VhlP40338 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VhlP40338 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VhlP40338 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VhlP40338 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VhlP40338 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VhlP40338 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VhlP40338 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VhlP40338 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VhlP40338 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VhlP40338 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VhlP40338 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VhlP40338 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VhlP40338 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VhlP40338 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VhlP40338 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VhlP40338 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VhlP40338 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VhlP40338 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VhlP40338 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VhlP40338 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms