Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tjp1P39447 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tjp1P39447 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms