Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flt1P35969 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flt1P35969 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flt1P35969 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flt1P35969 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flt1P35969 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flt1P35969 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flt1P35969 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Flt1P35969 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Flt1P35969 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Flt1P35969 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flt1P35969 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flt1P35969 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Flt1P35969 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flt1P35969 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Flt1P35969 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms