Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprkP35822 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtprkP35822 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PtprkP35822 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprkP35822 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprkP35822 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprkP35822 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprkP35822 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprkP35822 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprkP35822 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PtprkP35822 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PtprkP35822 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PtprkP35822 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PtprkP35822 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms