Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Grin1P35438 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin1P35438 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin1P35438 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin1P35438 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin1P35438 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin1P35438 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grin1P35438 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin1P35438 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin1P35438 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin1P35438 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms