Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab5cP35278 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms