Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms