Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nedd1P33215 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms